Το εμβρυικό κυκλοφοριακό σύστημα διαμορφώνεται διαφορετικά από αυτό του ενήλικα. Πιο συγκεκριμένα, το έμβρυο τροφοδοτείται με οξυγονωμένο αίμα μέσω της ομφαλικής φλέβας, η οποία εισάγεται με τον ομφάλιο λώρο και στο ύψους του φλεβώδη πόρου διανέμει το αίμα στο ήπαρ και στην κάτω κοίλη φλέβα. Ο μεγαλύτερος όγκος του αίματος (70%) διανέμεται στο ήπαρ ώστε τα διατροφικά συστατικά να περάσουν στον μεταβολισμό του εμβρύου. Κατόπιν, το οξυγονωμένο αίμα που εισέρχεται στην κάτω κοίλη φλέβα αναμειγνύεται με μη οξυγονωμένο και κινείται προς την καρδιά. Εισέρχεται στον δεξιό κόλπο της και αναμειγνύεται ξανά με μη οξυγονωμένο αίμα προερχόμενο από την άνω κοίλη φλέβα. Επειδή η πίεση είναι υψηλότερη στον δεξιό κόλπο, η μεγαλύτερη ποσότητα αίματος κινείται προς στον αριστερό κόλπο μέσω του ωοειδούς τρήματος, το οποίο εξισορροπεί την διανομή αίματος μεταξύ των δυο κόλπων και παρακάμπτει την μη χρήσιμη πνευμονική κυκλοφορία. Στην συνεχεία, το αίμα αυτό επιστρέφει στην περιφερειακή κυκλοφορία του εμβρύου μέσω της αριστερής κοιλίας και της αορτής. Το αίμα που παρέμεινε στην δεξιά κοιλία παρακάμπτει και αυτό την πνευμονική κυκλοφορία μέσω του βοτάλειου πόρου και επιστρέφει στην περιφερειακή κυκλοφορία. Τέλος, το περιφερειακό αίμα επιστρέφει στον πλακούντα μέσω της κατιούσας αορτής και των δυο ομφαλικών αρτηριών.