Κατά την εξέταση της αυχενικής διαφάνειας, ελέγχονται και άλλοι, μικρότερης σημασίας, δείκτες (ύποπτα χαρακτηριστικά) χρωμοσωμικών ανωμαλιών.

Ένας τέτοιος δείκτης είναι και η αιματική ροή στον φλεβώδη πόρο.  Ο φλεβώδης πόρος είναι ένα μικρό αγγείο που συνδέει την ομφαλική φλέβα με την κάτω κοίλη φλέβα και παίζει καθοριστικό ρόλο στην μεταφορά οξυγονωμένου αίματος στον εγκέφαλο του εμβρύου.

Η ροή του αίματος έχει χαρακτηριστική κυματομορφή και η αναστροφή του κύματος Α αυτής της κυματομορφής σχετίζεται με αυξημένο κίνδυνο για χρωμοσωμικές ανωμαλίες, συγγενείς καρδιοπάθειες και εμβρυϊκό θάνατο.  Αναστροφή κύματος Α κατά την εξέταση της αυχενικής διαφάνειας εμφανίζεται περίπου στο 3% των εμβρύων με φυσιολογικά χρωμοσώματα (φυσιολογική παραλλαγή) αλλά και στο 65% των εμβρύων με σύνδρομο Down. Ο έλεγχος της αυχενικής διαφάνειας, του εμβρυϊκού καρδιακού ρυθμού, καθώς και της ελεύθερης β-hCG και PAPP-A στον μητρικό ορό σε συνδυασμό με τον έλεγχο της ροής του φλεβώδη πόρου αυξάνει το ποσοστό ανίχνευσης των εμβρύων με σύνδρομο Down στο 95%.